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江(jiang)口蘿蔔豬UCP3 基(ji)因變(bian)異(yi)及其(qi)表(biao)達量(liang)與(yu)肉(rou)質性狀關(guan)聯性分析
發(fa)布時(shi)間:2021/5/28
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解(jie)耦聯(lian)蛋(dan)白(uncoupling protein, UCPs)是線(xian)粒體(ti)上(shang)的(de)質子載體(ti),以質子漏方式(shi)把H+從外(wai)膜(mo)傳(chuan)遞(di)到內膜(mo)(Ricquier, Frédéric, 2000)。在(zai)氧(yang)化磷酸(suan)化過程(cheng)中,可(ke)以降(jiang)低(di)膜(mo)內外(wai)的電(dian)化學梯(ti)度,在電(dian)子傳遞(di)過程(cheng)中實現(xian)質子回流(liu),從而起(qi)到(dao)讓(rang)呼吸(xi)鏈與ATP合(he)成(cheng)過程(cheng)解(jie)耦聯(lian)的作(zuo)用(yong),使(shi)能量(liang)以(yi)熱能(neng)的(de)形(xing)式散(san)發(fa),氧(yang)化磷酸(suan)化合(he)成(cheng)ATP 的效率(lv)下(xia)降(jiang)(張(zhang)雷等, 2010)。UCP3 基(ji)因是(shi)UCPs 家族成(cheng)員(yuan)之壹(yi),與UCP2 基(ji)因緊密連鎖(suo)並(bing)定位(wei)於(yu)豬(zhu)的9 號(hao)染色體(ti)(Stone et al.,2015)。當受到脂(zhi)肪酸(suan)刺激(ji)時(shi),UCP3 基(ji)因表(biao)達量(liang)上(shang)調,且UCP3 蛋(dan)白參與脂(zhi)肪酸(suan)和其他(ta)陰離(li)子跨(kua)膜(mo)轉(zhuan)運(Lapice et al., 2017)。UCP3 活性對脂肪(fang)酸(suan)氧(yang)化和氨(an)基(ji)酸(suan)代(dai)謝(xie)及(ji)其相關的生化途(tu)徑具有(you)重(zhong)要調節作(zuo)用(yong)(Aguer et al., 2016)。所以(yi),很(hen)多(duo)畜(chu)禽(qin)研究(jiu)者(zhe)將其(qi)作(zuo)為壹(yi)個(ge)影響肉(rou)品質的重(zhong)要功能(neng)候選(xuan)基(ji)因展(zhan)開研究(jiu)。方美(mei)英等(2002)在對豬(Sus scrofa) UCP3 基(ji)因多(duo)態(tai)性的研(yan)究(jiu)中,在(zai)內含(han)子3 發(fa)現(xian)了(le)T272G變(bian)異位(wei)點(dian)。李(li)艷華等(2006)分析了長白豬、杜(du)洛克等5個(ge)國(guo)內外(wai)豬種(zhong)UCP3 基(ji)因的(de)多(duo)態(tai)位點(dian),發(fa)現(xian)位(wei)於(yu)啟動子區的SNPs位(wei)點(dian)會造成(cheng)轉錄因子結合(he)位(wei)點(dian)的(de)改(gai)變(bian),影響對UCP3 基(ji)因的(de)轉(zhuan)錄和調控(kong),從而影響豬(zhu)的生產性能。陳(chen)哲(zhe)(2011)在(zai)UCP3 基(ji)因cDNA上(shang)檢(jian)測到(dao)A448G突(tu)變位(wei)點(dian),並(bing)發(fa)現(xian)該位點(dian)等位基(ji)因A對於(yu)改(gai)善(shan)豬(zhu)脂(zhi)肪(fang)性狀具有(you)積(ji)極作(zuo)用(yong)。王陽(yang)等(2011)研究(jiu)發(fa)現(xian)UCP3 參與豬(zhu)骨骼肌(ji)細(xi)胞脂(zhi)肪(fang)代謝(xie)的調(tiao)節,從而影響地(di)方(fang)豬(zhu)種(zhong)的(de)肉(rou)質和其他(ta)性狀。但(dan)是(shi)關(guan)於(yu)UCP3 基(ji)因表(biao)達量(liang)與(yu)肉(rou)質性能之間的(de)相(xiang)關性尚未(wei)見(jian)研究(jiu)報道。
本研(yan)究(jiu)以貴(gui)州優良地(di)方(fang)品(pin)種(zhong)江(jiang)口蘿蔔豬為實驗(yan)材料(liao),屠宰(zai)後(hou)測(ce)定(ding)其(qi)11 項主要肉(rou)質性能指(zhi)標,並提取(qu)背(bei)最(zui)長肌(ji)中(zhong)的基(ji)因組(zu)DNA建(jian)立(li)混(hun)合(he)DNA池(chi),擴(kuo)增UCP3 基(ji)因全(quan)部(bu)外(wai)顯(xian)子並測(ce)序,初步篩(shai)選(xuan)多(duo)態(tai)位點(dian),然(ran)後以單(dan)個(ge)樣本(ben)DNA為模(mo)板(ban),擴(kuo)增篩選(xuan)到的(de)位(wei)點(dian)對應外(wai)顯(xian)子,用(yong)以測序驗(yan)證並分(fen)型。對應肉(rou)質指標,對不同(tong)基(ji)因型豬進(jin)行(xing)肉(rou)質性能差異(yi)分析。提取(qu)背(bei)最(zui)長肌(ji)總RNA,檢(jian)測不(bu)同基(ji)因型江(jiang)口蘿蔔豬背(bei)最(zui)長肌(ji)中(zhong)UCP3 基(ji)因的(de)平(ping)均(jun)表(biao)達量(liang)做(zuo)差異(yi)顯(xian)著性分析,分析基(ji)因型、表(biao)達量(liang)與(yu)及肉(rou)質性能三(san)者(zhe)之間的(de)關(guan)聯性,以期(qi)探尋UCP3 基(ji)因多(duo)態(tai)性對江(jiang)口蘿蔔豬肉(rou)質性能的(de)影響,為科學的(de)選(xuan)種(zhong)選(xuan)育提供(gong)基(ji)礎(chu)材(cai)料。
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